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epicypher 13-2010說明書

 更新時(shí)間:2022-11-15 點(diǎn)擊量:1242

HA Tag CUTANA™ CUT&RUN Antibody

產(chǎn)品概述

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類型:多克隆

主機(jī):兔

目標(biāo)大小:不適用

格式:親和純化 IgG

反應(yīng):HA表位(YPYDVPDYA)

應(yīng)用:切割和運(yùn)行,WB

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HA 抗體 (0.5 μg) 和 500,000 個(gè) MDA-MB-231 細(xì)胞穩(wěn)定表達(dá) c 端 3xHA 標(biāo)記的 GATA3 [1]*.使用MACS2調(diào)用峰值。(一)顯示GATA3-3xHA峰的熱圖 相對(duì)于 IgG 和 H3K4me3 對(duì)照抗體(分別為 EpiCypher 13-0042 和13-0041),按強(qiáng)度排列(頂部至 底部)并著色,紅色表示高度本地化 富集和藍(lán)色表示背景信號(hào)。(二)GATA3-3xHA峰值的數(shù)量 屬于功能注釋基因組的不同類別 繪制區(qū)域。

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A)荷馬分析中的分析確定 GATA3 共識(shí)主題,表示為序列徽標(biāo) 位置權(quán)重矩陣,在GATA3-3xHA下富集 切割和運(yùn)行峰值。(二)GATA3-3xHA的數(shù)量 含有來自圖A的GATA3共識(shí)基序的峰是 由維恩圖表示。(中四)二 代表性位點(diǎn)顯示GATA3-3xHA峰與 下面提到的共識(shí)主題(IGV)。

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(A)一組重組核小體 創(chuàng)建其中各種表位標(biāo)簽(3xTY1,3xFLAG,3xHA) 融合到組蛋白H3尾部。融合的核小體和 將未修飾的對(duì)照固定在鏈霉親和素珠上 (SA Bead)并與ConA一起加標(biāo)到CUT&RUN樣品中 磁珠固定3xHA MDA-MB-231細(xì)胞(圖1)。高可用性標(biāo)簽 然后加入抗體和pAG-MNase(EpiCypher15-1016)以釋放抗體結(jié)合的核小體 通過pAG-MNase介導(dǎo)的裂解進(jìn)入溶液 接頭DNA(淺藍(lán)色)。這種方法提供了一個(gè)定義的 實(shí)驗(yàn)對(duì)照以評(píng)估HA Tag抗體是否 選擇性切割具有高特異性的靶表位 和最小的背景。(二)CUT&RUN序列讀數(shù)與獨(dú)te的DNA比對(duì) “條形碼"對(duì)應(yīng)于刺入中的每個(gè)核小體 面板。數(shù)據(jù)表示為恢復(fù)的讀取百分比 相對(duì)于預(yù)期目標(biāo)(3xHA,設(shè)置為 100%)。這 分析證實(shí)HA標(biāo)簽抗體特異性 將靶表位標(biāo)記的核小體釋放到 溶液。

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多標(biāo)簽融合蛋白的大腸桿菌細(xì)胞蛋白 用于制備全細(xì)胞裂解物。指示的 將一定量(ng)的裂解物上樣到4-20%SDS-PAGE凝膠上 并在標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)印跡條件下使用 HA 進(jìn)行分析 標(biāo)記抗體 (1:25,000)。

免疫原

合成的HA肽(序列:YPYDVPDYA)。

配方

磷酸鹽中的抗原親和純化抗體 (1.0 mg/mL) 緩沖鹽水(PBS),0.09%sodium azide。

儲(chǔ)存和穩(wěn)定性

自收到之日起在 4°C 下穩(wěn)定保存 1 年。

推薦稀釋度:

切割和運(yùn)行:0.5 微克

蛋白質(zhì)印跡 (WB):1:1,000 - 1:30,000

背景參考文獻(xiàn):

[1] Takakuet al.基因組生物學(xué).(2016). PMID:26922637

*感謝 Takaku 博士 (UND) 的 3xFlag-GATA3-3xHA MDA-MB-231 細(xì)胞。

產(chǎn)品詳情

名稱      HA Tag CUTANA™ CUT&RUN Antibody

編號(hào)      13-2010

品牌      epicypher 

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